Software
Quando si lavora con dati complicati ed in grande quantità, prestazioni analitiche anche eccezionali dello spettrometro di massa rischiano di non poter essere adeguatamente interpretate se i software utilizzati non sono in grado di gestire le informazioni in maniera completa e facile per il ricercatore. Se lo stesso software di gestione ed acquisizione è poco “user friendly”, può essere addirittura così difficile impostare correttamente le condizioni di utilizzo da lavorare costantemente sotto le potenzialità della dotazione cromatografica e spettrometrica: non è un caso infrequente utilizzare un Q-TOF come semplice TOF a causa del disarmante setup dell’autotuning più lungo a volte della durata stessa delle analisi.
Tutti i programmi di gestione, acquisizione e analisi di Agilent Technologies sono creati pensando alla facilità d’uso e a rendere appieno sfruttabili le prestazioni strumentali, sia che dobbiate quantificare velocemente metaboliti di farmaci sia che vogliate caratterizzare un complesso profilo proteico.
Nell’ottica di dare all’utilizzatore tutti i mezzi di cui ha bisogno, il portafoglio software è almeno tanto ricco quanto quello strumentale:
Tutti i programmi di gestione, acquisizione e analisi di Agilent Technologies sono creati pensando alla facilità d’uso e a rendere appieno sfruttabili le prestazioni strumentali, sia che dobbiate quantificare velocemente metaboliti di farmaci sia che vogliate caratterizzare un complesso profilo proteico.
Nell’ottica di dare all’utilizzatore tutti i mezzi di cui ha bisogno, il portafoglio software è almeno tanto ricco quanto quello strumentale:
MASSHUNTER WORKSTATION Software
Il nuovo software Masshunter, disegnato ex-novo per gestire tripli quadrpoli, Q-TOF e TOF offre:
Il nuovo software Masshunter, disegnato ex-novo per gestire tripli quadrpoli, Q-TOF e TOF offre:
- Autotuning completo per tutti gli spettrometri gestiti, (e naturalmente volendo è anche possibile gestire autonomamente tutti i parametri);
- Importazione setup anche da fogli di calcolo (ad esempio Excel®);
- Gestione completa della spettrometria di massa come anche della cromatografia;
- Feature Extraction per estrarre solo le caratteristiche importanti del cromatogramma acquisito ad esempio il segnale analitico dai picchi coeluenti;
- Navigazione dei risultati sample-centric o compound-centric;
- Curve fit assistant con statistica sulla bontà della curva scelta;
- Integratore picchi parameter-less;
- Correlazione integratore VS curva di calibrazione (curve ricalcolate automaticamente quando i picchi vengono reintegrati);
- Utilissima funzione di flagging degli outliers per evidenziare immediatamente i valori sospetti: concentrazioni, tempi di ritenzione, ion-ratio ecc.;
- Reports preconfigurati o configurabili in Microsoft® Excel; risultati salvati in XML per esportarli facilmente;
MASSHUNTER BIOCONFIRM Software
Software completo per la conferma delle identità di peptidi e proteine.
Ideale per chi vuole combinare la conferma dell’identità di proteine conosciute o peptidi sintetici con l’espressione di proteine ricombinanti.
Per saperne di più vedi al sito Agilent
Software completo per la conferma delle identità di peptidi e proteine.
Ideale per chi vuole combinare la conferma dell’identità di proteine conosciute o peptidi sintetici con l’espressione di proteine ricombinanti.
- Algoritmi di deconvoluzione;
- Editor di sequenze peptidiche, digeriti o nuove proteine e confronto con le masse teoriche;
- Feature Extraction;
- Esportazione delle liste di massa in software di ricerca da database per l’identificazione.
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MASSHUNTER METABOLITE ID Software
Software per l’dentificazione semplice e diretta di metaboliti:
Per saperne di più vedi al sito Agilent
Software per l’dentificazione semplice e diretta di metaboliti:
- Basato sui dati di massa esatta MS o MS/MS del Q-TOF serie 6500;
- Molecular Feature Extraction;
- Valutazione del main isotope, neutral loss,
- Dati estratti in minor tempo e con sicurezza: grande produttività
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MASSHUNTER PROFILING Software
Software specifico per applicazioni di profiling di espressione, ad esempio per l’identificazione di biomarkers. Con algoritmi di correlazione e l’esclusivo Feature Extraction Software identifica tutte le caratteristiche molecolari, non solo i singoli picchi.
Software specifico per applicazioni di profiling di espressione, ad esempio per l’identificazione di biomarkers. Con algoritmi di correlazione e l’esclusivo Feature Extraction Software identifica tutte le caratteristiche molecolari, non solo i singoli picchi.
- Opzioni di visualizzazione delle differenze significative (ad esempio malato VS controllo);
- Identificazione chiara dei rapporti tra abbondanze;
- Flessibilità nella selezione dei criteri di confronto;
- Esportazione dei dati di profiling verso strumenti di identificazione di ricerca in database o di analisi statistica (ad esempio Agilent GeneSpring MS software);
- Supporto anche a differenti workflow come analisi di impurezze farmaceutiche, di tossicologia o analisi ambientali;
METLIN PERSONAL METABOLITE DATABASE Software
Nell’ottica della semplificazione del workflow, soprattutto quando l’identificazione rapida dei metaboliti è di vitale importanza, oggi Agilent è l’unica società in grado di fornire un database di metaboliti, (endogeni ed esogeni, con di- e tri-peptidi), contenente oltre 15.000 composti:
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Nell’ottica della semplificazione del workflow, soprattutto quando l’identificazione rapida dei metaboliti è di vitale importanza, oggi Agilent è l’unica società in grado di fornire un database di metaboliti, (endogeni ed esogeni, con di- e tri-peptidi), contenente oltre 15.000 composti:
- Nome, massa, formula chimica, formula di struttura, eventuale tempo di ritenzione; di- e tri-peptidi;
- Possibilità di personalizzazione con inserimento di propri composti da parte dell’utilizzatore, anche proprietari;
- Ricerca automatica;
- Link a MassHunter (acquisizione), MassProfiler e a GeneSpring MS (analisi statistica);
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SPECTRUM MILL FOR MASSHUNTER Workstation
Per l’identificazione di proteine e peptidi attraverso ricerca in database, con particolare riguardo alla minimizzazione dei falsi positivi e con strumenti manuali di validazione delle correlazioni. Inoltre se il risultato da libreria non è soddisfacente è sempre presente la possibilità di de novo spectral interpretation.
Per l’identificazione di proteine e peptidi attraverso ricerca in database, con particolare riguardo alla minimizzazione dei falsi positivi e con strumenti manuali di validazione delle correlazioni. Inoltre se il risultato da libreria non è soddisfacente è sempre presente la possibilità di de novo spectral interpretation.- Intelligent spectral extraction prima della ricerca in libreria per escludere rumore e dati di scarsa qualità, con miglioramento della velocità e diminuzione di falsi positivi;
- Possibilità di operare in modalità “identity”, “variable modifications o “homology” per poter considerare mutazioni, modificazioni chimiche o post-traslazionali, anche definite dall’utilizzatore;
- Gestione del profiling basato su marcatura isotopica;
- Molteplici opzioni di validazione del risultato e ripetizione della ricerca in caso di risultato non soddisfacente;
- De novo sequencing;
- Quantificazione;
- Memorizzazione parametrizzata dei risultati; in questo modo qualsiasi risultato può essere richiamato in base a numerosissimi criteri (ad esempio: score, peso molecolare, categoria, numero di peptidi, intensità segnale, ione precursore ecc.);
- Compatibilità con dati provenienti da software Thermo, Sciex, Micromass.
GENESPRING MS Software
Genespring MS è una potente piattaforma di analisi statistica ed associazione di dati correlati per importare, visualizzare e analizzare risultati di spettrometria di massa sia GC/MS che LC/MS; partendo da grandi volumi di dati è possibile individuare solo le proprietà veramente interessanti e correlarle o differenziarle tra loro in maniera efficace ed elegante.
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Genespring MS è una potente piattaforma di analisi statistica ed associazione di dati correlati per importare, visualizzare e analizzare risultati di spettrometria di massa sia GC/MS che LC/MS; partendo da grandi volumi di dati è possibile individuare solo le proprietà veramente interessanti e correlarle o differenziarle tra loro in maniera efficace ed elegante.
- Analisi veloce di biomarkers;
- Confronto tra moltissimi campioni;
- Strumenti statistici quali ANOVA, PCA, t-tests, volcano plots, hierarchical trees, SOMs, QT clustering ecc.;
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