Applicazioni
La piattaforma Agilent si caratterizza per completezza, integrazione tra hardware, arrays e software, flessibilità, qualità e affidabilità; grazie a queste caratteristiche le applicazioni sviluppate sulla piattaforma possono essere le più varie per dare al grande centro uno strumento in grado di essere utile a più gruppi e per più linee di ricerca; nel contempo dare al piccolo gruppo di ricercatori la sicurezza che qualsiasi sia l’evoluzione dei loro studi, Agilent sarà in grado di supportarli.
Dual Mode Gene Expression
Le possibilità offerte oggi da quella che è stata la prima applicazione degli arrays sono illimitate: esperimenti ad un colore o due, estesa copertura del genoma con arrays ad alta densità o analisi mirate grazie ai differenti formati, altissima sensibilità anche per bassi livelli di espressione, possibilità di analisi di campioni paraffinati, altissima accuratezza grazie alla concordanza coi dati TaqMan.
E naturalmente un esteso catalogo di organismi a cui potete sempre aggiungere il vostro personalizzato grazie a e-array.
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Comparative Genomic Hybridization
aCGH è oggi lo strumento più potente per identificare e caratterizzare copy number variations sul genoma. Con la flessibilità degli arrays ad alta o bassa densità è possibile esaminare l’intero genoma o scegliere con e-array la zona di interesse e disegnare esperimenti con una risoluzione media inferiore a 100bp.
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Scopri le prestazioni dell’analisi aCGH Agilent:
Assessing Array CGH Platform Performance between Commercial Products
Dual Mode Gene ExpressionLe possibilità offerte oggi da quella che è stata la prima applicazione degli arrays sono illimitate: esperimenti ad un colore o due, estesa copertura del genoma con arrays ad alta densità o analisi mirate grazie ai differenti formati, altissima sensibilità anche per bassi livelli di espressione, possibilità di analisi di campioni paraffinati, altissima accuratezza grazie alla concordanza coi dati TaqMan.
E naturalmente un esteso catalogo di organismi a cui potete sempre aggiungere il vostro personalizzato grazie a e-array.
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Comparative Genomic HybridizationaCGH è oggi lo strumento più potente per identificare e caratterizzare copy number variations sul genoma. Con la flessibilità degli arrays ad alta o bassa densità è possibile esaminare l’intero genoma o scegliere con e-array la zona di interesse e disegnare esperimenti con una risoluzione media inferiore a 100bp.
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Cromatin Immunoprecipitation (ChIP on Chip)
La tecnica ChIP on Chip permette di monitorare il comportamento della zona del promotore di trascrizione per capire i meccanismi di up- e down-regulation dei geni: un ponte tra espressione genica e proteomica reso possibile da arrays che combinano estesa copertura del genoma e grande sensibilità.
Ed è possibile personalizzare gli esperimenti con arrays da proprio disegno passando dall’ipotesi di espressione alla sua verifica.
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Applicazioni e condivisione tecniche su opengenomics
La tecnica ChIP on Chip permette di monitorare il comportamento della zona del promotore di trascrizione per capire i meccanismi di up- e down-regulation dei geni: un ponte tra espressione genica e proteomica reso possibile da arrays che combinano estesa copertura del genoma e grande sensibilità.
Ed è possibile personalizzare gli esperimenti con arrays da proprio disegno passando dall’ipotesi di espressione alla sua verifica.
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Metilazione
Con gli arrarys per metilazione sia personalizzati che a catalogo focalizzati sulle regioni CpG Island o del promotore, è possibile investigare a fondo gli eventi epigenetici di metilazione che alterano la regolazione dell’espressione genica.
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Con gli arrarys per metilazione sia personalizzati che a catalogo focalizzati sulle regioni CpG Island o del promotore, è possibile investigare a fondo gli eventi epigenetici di metilazione che alterano la regolazione dell’espressione genica.Scoprine di più sulla tecnica al sito Agilent
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miRNA
Oggi Agilent è in grado di fornire strumenti per l’analisi dei frammenti miRNA quali importanti fattori di regolazione post-trascrizionale. La ridotta dimensione dei frammenti è sempre stata un ostacolo all’analisi di miRNA con tecnica microarray; questo ostacolo è stato oggi superato grazie a innovativi strumenti di marcatura ed una originale struttura delle sonde che impediscono ibridazioni aspecifiche.
Gli arrays ed i protocolli di analisi di Agilent Technologies offrono ottima specificità e sensibilità nella discriminazione sia delle sequenze che delle loro dimensioni. Questo eccezionale risultato lo si deve tanto ad un originale disegno delle sonde, quanto alla procedura di marcatura diretta estremamente efficace che alla sintesi in situ delle sonde (SurePrint inkjet technology); è possibile utilizzare così fino anche a soli 100ng di RNA totale!
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Applicazioni e condivisione tecniche su opengenomics
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Oggi Agilent è in grado di fornire strumenti per l’analisi dei frammenti miRNA quali importanti fattori di regolazione post-trascrizionale. La ridotta dimensione dei frammenti è sempre stata un ostacolo all’analisi di miRNA con tecnica microarray; questo ostacolo è stato oggi superato grazie a innovativi strumenti di marcatura ed una originale struttura delle sonde che impediscono ibridazioni aspecifiche.
Gli arrays ed i protocolli di analisi di Agilent Technologies offrono ottima specificità e sensibilità nella discriminazione sia delle sequenze che delle loro dimensioni. Questo eccezionale risultato lo si deve tanto ad un originale disegno delle sonde, quanto alla procedura di marcatura diretta estremamente efficace che alla sintesi in situ delle sonde (SurePrint inkjet technology); è possibile utilizzare così fino anche a soli 100ng di RNA totale!
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Splice Variants Analysis
Lo splicing alternativo è il processo attraverso il quale il preRNA viene alterato, generando differenti mRNA e quindi differenti proteine
Con arrays e protocolli progettati dalla Exonhit Therapeutics, oggi Agilent Technologies è in grado di fornire prodotti per specifici trascrittomi
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Lo splicing alternativo è il processo attraverso il quale il preRNA viene alterato, generando differenti mRNA e quindi differenti proteine
Con arrays e protocolli progettati dalla Exonhit Therapeutics, oggi Agilent Technologies è in grado di fornire prodotti per specifici trascrittomi
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