Elettroforesi RNA

La verifica dell’integrità dell’RNA è uno step essenziale nelle analisi di espressione genica nelle moderne tecniche di ibridazione su microarrays di cDNA, ma anche in quelle più tradizionali come la RT-PCR. L’elettroforesi su gel automatizzata con chips microfluidici permette una caratterizzazione del campione non solo veloce e affidabile, ma anche indipendente dal singolo esperimento, dall’operatore e dal laboratorio in cui venga effettuata la prova.
Infatti non si deve far altro che dosare nel chip i campioni (fino ad un massimo di 12) e i reagenti e far partire l’analisi, il tutto seguendo una metodica precisa già ottimizzata.

dna

Il software con l’esclusiva funzione di valutazione “RIN “(RNA Integrity Number), dà una misura accurata e riproducibile dello stato del campione e si configura così come il primo strumento automatico di standardizzazione dell’RNA, in grado di assegnare un valore confrontabile anche tra laboratori siti a centinaia di chilometri di distanza.

L’assenza di RNasi in reagenti, chips e accessori evita la degrazione del campione durante l’analisi.

Quantità di mRNA e RNA totale anche di soli 200pg, vengono determinate da campioni di solo 1 µL

Oltre al citato QC di RNA totale, altre applicazioni finora sviluppate includono l’analisi di RNA da campionamenti per laser microdissection, l’analisi di RNA marcato con sonde fluorescenti (come ad esempio Cy5), la determinazione della presenza di contaminazioni di RNA ribosomale o di DNA.

Scoprite di più sulle applicazioni di elettroforesi RNA, sul sito Agilent Technologies

Specifiche

	Agilent RNA 6000 Nano kit		Agilent RNA 6000 Pico kit
Specifiche Analitiche	Total RNA	mRNA	Total RNA	mRNA
Range Quantitativo	25÷500 ng/µL	25÷250 ng/µL	—	—
Range Qualitativo	5÷500 ng/µL	25÷250 ng/µL	50÷5.000 pg/µL (in acqua)	250÷5.000 pg/µL (in acqua)
Sensibilità (S/N > 3)	5 pg/µL in acqua	250 pg/µL in acqua	50 pg/µL in acqua, 200 pg/µL in TE	250 pg/µL in acqua, 500 pg/µL in TE
Riproducibilità quantitativa	10 % CV (all’interno del chip)	10 % CV (all’interno del chip)	20 % CV (all’interno del chip)	20 % CV (all’interno del chip)
Accuratezza*	20 % CV	20 % CV	30 % CV	30 % CV
Compatibilità tamponi	100mM Tris, 0,1mM EDTA o 125mM NaCl o 15mM MgCl2	100mM Tris, 0,1mM EDTA o 125mM NaCl o 15mM MgCl2	50mM Tris, 0,1mM EDTA o 50mM NaCl o 15mM MgCl2	50mM Tris, 0,1mM EDTA o 50mM NaCl o 15mM MgCl2
Specifiche Fisiche
Tempo di analisi	30 minuti	30 minuti	30 minuti	30 minuti
Quantità di campione	1 µL	1 µL	1 µL	1 µL
Numero di campioni	12/chip	12/chip	11/chip	11/chip
Stabilità chips	Più di 4 mesi se conservati in maniera appropriata

* Verifica sul ladder di RNA

Per ordinare

Codice Prodotto	Descrizione
5067-1511	RNA 6000 Nano Kit	Kit per analisi e quantificazione di campioni di RNA totale o messaggero, include 25 chips (da 12 campioni l’uno), 2 chips pulitura, siringa, reagenti, accessori e la guida ai reagenti
5067-1514	RNA 6000 Pico Kit	Kit ad alta risoluzione per analisi di campioni di RNA totale o messaggero, include 25 chips (da 12 campioni l’uno), 2 chips pulitura, siringa, reagenti, accessori e la guida ai reagenti
5067-1513	RNA 6000 Pico Reagents	Include i soli reagenti, ladder e marker
5067-1535	Ladder per Agilent RNA 6000 Pico
5067-1512	RNA 6000 Nano Reagents	Include i soli reagenti, ladder e marker
5067-1529	Ladder per Agilent RNA 6000 Nano